27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2710 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  52.21 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  52.63 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  51.33 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  51.75 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  51.3 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  61.46 
 
 		 167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  53.15 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  52.78 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  56.38 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  54.74 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  51.58 
 
 		 212 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  45.3 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  43.16 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  38.14 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  38.3 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  37.89 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  39.36 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  34.04 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  31.62 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  30.69 
 
 		 179 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  31.91 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  30.11 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  32.14 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>