21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2598 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  234  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  58.49 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0037  hypothetical protein  58.04 
 
 		 172 aa  121  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  55.75 
 
 		 179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  49.09 
 
 		 184 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  47.79 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  44.14 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2875  hypothetical protein  44.14 
 
 		 116 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  41.94 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  35.92 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  39.22 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  31.86 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  42.16 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  36.79 
 
 		 173 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  35.51 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  35.24 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  36.71 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  31.48 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  29.25 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  31.91 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>