27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3167 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  60 
 
 
184 aa  153  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  44.81 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  49.57 
 
 
170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  47.79 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2875  hypothetical protein  53.98 
 
 
116 aa  110  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0037  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  45.16 
 
 
179 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  41.67 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  34.09 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  38.6 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  33.59 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  28.3 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  27.44 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  36.19 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  35.19 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  36.11 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  31.07 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  23.53 
 
 
167 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  27.04 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  29.82 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  32.05 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  32.67 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  29.17 
 
 
177 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  31.37 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>