28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2181 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  50.31 
 
 
154 aa  156  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  53.7 
 
 
170 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2875  hypothetical protein  53.57 
 
 
116 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  49.09 
 
 
113 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  36.42 
 
 
156 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  46.83 
 
 
179 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0037  hypothetical protein  51.79 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  37.17 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  34.43 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  35.9 
 
 
118 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  37.27 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  31.15 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  32.76 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  30.47 
 
 
173 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  27.78 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  30.61 
 
 
118 aa  44.3  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  31.58 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  30.09 
 
 
116 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  23.44 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  28.28 
 
 
118 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  30.11 
 
 
118 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  26.67 
 
 
142 aa  41.2  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  25.95 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>