19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0356 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  52.68 
 
 
195 aa  130  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1722  hypothetical protein  34.29 
 
 
117 aa  84.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  34.17 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  37.96 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  35.59 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  35.92 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  35.59 
 
 
169 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  34.51 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  30.33 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  34.34 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  29.27 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  29.27 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  32.14 
 
 
179 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  31.36 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0037  hypothetical protein  32.53 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2875  hypothetical protein  32.41 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>