25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4454 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  275  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  38.6 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  39.02 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  37.07 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  34.17 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  43.08 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  29.6 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  28.21 
 
 		 177 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  36.71 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  29.57 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  41.38 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  27.12 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  32.05 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  31.11 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  41.94 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  27.35 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  28.7 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  28.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  29.52 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  32.22 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  25.2 
 
 		 171 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>