30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3050 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  55.56 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  57.52 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  51.33 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  52.59 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  52.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  51.24 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  51.72 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  48.72 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  47.79 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  46.02 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  47.32 
 
 		 169 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  48.7 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  43.97 
 
 		 171 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  38.33 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  41.03 
 
 		 212 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  45.45 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  38.95 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  34.78 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  35.11 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  44.78 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  31.07 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3400  hypothetical protein  58.49 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  28.71 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  37.84 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  35.05 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  27.12 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  28.28 
 
 		 184 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>