23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3400 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3400  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  69.09 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  65.45 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  63.64 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  64.71 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  60.38 
 
 
169 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  61.11 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  58.49 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  55.36 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  52.73 
 
 
118 aa  57.4  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  43.64 
 
 
177 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  44.07 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  47.27 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  47.27 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  43.64 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  48.08 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  43.64 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  39.29 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  39.62 
 
 
327 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  29.63 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  35.19 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>