27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1581 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  66.67 
 
 		 171 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  57.02 
 
 		 165 aa  138  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  57.55 
 
 		 118 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  51.72 
 
 		 147 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  55.34 
 
 		 167 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  57 
 
 		 169 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  47.58 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  44.95 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  43.51 
 
 		 173 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  51.58 
 
 		 118 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  43.8 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  51.52 
 
 		 116 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  40.48 
 
 		 142 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  48.48 
 
 		 124 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  41.03 
 
 		 118 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  42.05 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  32.8 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  42.05 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  31.67 
 
 		 327 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  37.17 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  35.09 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  29.25 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  30.93 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  28.04 
 
 		 136 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>