22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3142 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  352  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  53.72 
 
 
327 aa  142  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  35.24 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  32.48 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  33.63 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  34.58 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  32.8 
 
 
212 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  27.43 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  36.9 
 
 
116 aa  72  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  35.11 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  32.35 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  34.04 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  32.54 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  31.96 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  33.96 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  35.63 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  29.36 
 
 
177 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  33.75 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  39.06 
 
 
197 aa  53.9  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  35.94 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  25.24 
 
 
156 aa  42  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>