27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001031 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  49.57 
 
 
118 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  48.28 
 
 
173 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  45.69 
 
 
165 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  48.25 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  47.79 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  47.37 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  46 
 
 
177 aa  111  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  46.55 
 
 
171 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  49.52 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  54.35 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  44.74 
 
 
169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  51.52 
 
 
212 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  43.33 
 
 
142 aa  104  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  38.26 
 
 
156 aa  95.9  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  37.07 
 
 
327 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  36.9 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  39.18 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  33.04 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  31.73 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  30.61 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  29.82 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  30.09 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>