90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3095 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3095  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.471636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3082  hypothetical protein  98.94 
 
 		 290 aa  383  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000317552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0910  protein of unknown function DUF477  97.52 
 
 		 290 aa  279  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02623  hypothetical protein  97.52 
 
 		 290 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02585  hypothetical protein  97.52 
 
 		 290 aa  279  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000156395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0934  hypothetical protein  97.52 
 
 		 290 aa  279  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000566742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2920  hypothetical protein  97.78 
 
 		 242 aa  259  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.83358e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2915  hypothetical protein  85.44 
 
 		 294 aa  257  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0386021  normal  0.901055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2913  hypothetical protein  35.23 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00131763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3876  glycine rich protein  51.79 
 
 		 440 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1288  hypothetical protein  47.17 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45700  hypothetical protein  50 
 
 		 453 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45710  hypothetical protein  38.89 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3877  hypothetical protein  53.06 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2363  protein of unknown function DUF477  48.98 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.116241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1082  hypothetical protein  35.16 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1821  hypothetical protein  35.16 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1753  hypothetical protein  35.16 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1259  protein of unknown function DUF477  40.51 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.642039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1773  hypothetical protein  37.78 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.61154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0956  hypothetical protein  26.5 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2527  hypothetical protein  33.02 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00024916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2160  hypothetical protein  31.37 
 
 		 284 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0897  hypothetical protein  33.82 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.803851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2021  hypothetical protein  38.46 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000021885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2277  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000559255  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6199  hypothetical protein  27.85 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0414  protein of unknown function DUF477  33.33 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2422  protein of unknown function DUF477  29.55 
 
 		 287 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3227  hypothetical protein  31.87 
 
 		 277 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1189  hypothetical protein  30.86 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3392  hypothetical protein  34.21 
 
 		 277 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.261896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1903  putative glycine rich membrane protein  28.41 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06980  hypothetical protein  39.39 
 
 		 341 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2033  hypothetical protein  30.53 
 
 		 285 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1823  protein of unknown function DUF477  28.42 
 
 		 250 aa  48.1  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0387884  normal  0.867329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0416  hypothetical protein  33.8 
 
 		 287 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0454  hypothetical protein  30.43 
 
 		 389 aa  47.8  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2019  hypothetical protein  40.74 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0639  hypothetical protein  35.71 
 
 		 343 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0410  hypothetical protein  30.43 
 
 		 386 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00804923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1981  protein of unknown function DUF477  40.74 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1419  protein of unknown function DUF477  38.67 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0878  hypothetical protein  38.98 
 
 		 279 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1372  hypothetical protein  28.89 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740234  hitchhiker  0.000166638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2296  protein of unknown function DUF477  40.74 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1228  protein of unknown function DUF477  41.51 
 
 		 315 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0394  hypothetical protein  31.88 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.729327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1230  protein of unknown function DUF477  31.63 
 
 		 294 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0298184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47040  hypothetical protein  42.86 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5849  protein of unknown function DUF477  38.6 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1670  hypothetical protein  46.81 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0599  hypothetical protein  30.93 
 
 		 396 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0663  putative glycine rich transmembrane protein  27.59 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1510  hypothetical protein  28.74 
 
 		 292 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1392  hypothetical protein  35.19 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0554  protein of unknown function DUF477  26.44 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.475788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0330  hypothetical protein  34.09 
 
 		 309 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3875  hypothetical protein  30.1 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0990  hypothetical protein  36.21 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1795  protein of unknown function DUF477  27.27 
 
 		 288 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.039663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2047  hypothetical protein  29.07 
 
 		 283 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.976247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1401  protein of unknown function DUF477  29.87 
 
 		 264 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6373  hypothetical protein  38.1 
 
 		 265 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0774641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5308  protein of unknown function DUF477  31.82 
 
 		 293 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.16736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1696  protein of unknown function DUF477  31.82 
 
 		 286 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.973781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1889  hypothetical protein  37.04 
 
 		 272 aa  44.7  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0380  hypothetical protein  31.82 
 
 		 313 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6688  hypothetical protein  30.99 
 
 		 295 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0102145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3713  hypothetical protein  30.34 
 
 		 301 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.915027  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4747  hypothetical protein  37.93 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0218065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1787  hypothetical protein  35.09 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000129243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1459  hypothetical protein  33.87 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000468004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1478  hypothetical protein  30.56 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1821  protein of unknown function DUF477  36.49 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367248  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4545  hypothetical protein  47.62 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2026  protein of unknown function DUF477  27.03 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.903181 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1830  hypothetical protein  35.09 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3955  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  27.59 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04780  hypothetical protein  38.89 
 
 		 267 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3401  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1186  hypothetical protein  29.07 
 
 		 258 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0460603  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0875  protein of unknown function DUF477  32.86 
 
 		 264 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000594367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0812  hypothetical protein  42.86 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0606  protein of unknown function DUF477  25.29 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4289  hypothetical protein  27.1 
 
 		 205 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3702  hypothetical protein  25.26 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83448  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1762  protein of unknown function DUF477  23.77 
 
 		 307 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>