121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2921 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2921  flagellar protein FliS  100 
 
 
129 aa  253  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  33.33 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  31.2 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1177  flagellar protein FliS  30.51 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0776613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0503  flagellar protein FliS  34.75 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0055  flagellar protein FliS  31.97 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  30.84 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0212  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  34.52 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.523673  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  31.75 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0061  flagellar protein FliS  32.79 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  29.57 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  33.07 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  28.93 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0187  flagellar protein FliS  34.48 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.158957  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2197  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.23 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  31.4 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  31.62 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0656  flagellar protein FliS  30.4 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  27.43 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  28.83 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  31.9 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  27.97 
 
 
136 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  28.83 
 
 
135 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  26.55 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1277  flagellar protein FliS  30.51 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  30.33 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3071  flagellar protein FliS  26.27 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  28.1 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1613  flagellar protein FliS  26.27 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  31.15 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3233  flagellar protein FliS  26.27 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  29.09 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  27.87 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3453  flagellar protein FliS  32.5 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2831  flagellar protein FliS  27.68 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.161705  normal  0.0204753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0704  flagellar protein FliS  32.74 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109575  normal  0.204071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3585  flagellar protein FliS  27.68 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  27.12 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1432  flagellar protein FliS  27.12 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2581  flagellar protein FliS  26.27 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  31.36 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3954  flagellar protein FliS  37.31 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0846761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  27.93 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02913  Flagellin-specific chaperone FliS  26.45 
 
 
139 aa  48.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1446  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.431309  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  28.1 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  27.03 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0384  flagellar protein FliS  28.1 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240684  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1337  flagellar protein FliS  25.42 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0984665  normal  0.272409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  28.46 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  29.13 
 
 
136 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2937  flagellar protein FliS  32.76 
 
 
154 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.706252  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1344  flagellar protein FliS  29.66 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1891  flagellar protein FliS  33.05 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2302  flagellar protein FliS  25.42 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.149284  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2941  flagellar protein FliS  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3073  flagellar protein FliS  25 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3356  flagellar protein FliS  29.17 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.385304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  31.67 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1496  flagellar protein FliS  28.3 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0407266  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001171  flagellar biosynthesis protein FliS  27.83 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.329244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0206  flagellar protein FliS  27.73 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0278  lateral flagellar chaperone protein LafC  29.17 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00844444  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0086  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.639004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  27.27 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1319  flagellar protein FliS  26.27 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4398  flagellar protein FliS  30.23 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1110  flagellar protein FliS  27.56 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.218751 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2700  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.11516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  29.31 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  28.23 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3082  flagellar protein FliS  28.35 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.699542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  24.79 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1256  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.25928 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1721  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.649676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  30.09 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0574  flagellar protein FliS  27.43 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.80072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1381  flagellar protein FliS  28.21 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2025  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2160  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0763  flagellar protein FliS  37.88 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.392725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1714  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.16255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4661  flagellar protein FliS  28.57 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.227103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1055  flagellar protein FliS  29.46 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.216537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  28.81 
 
 
152 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04955  flagellin-specific chaperone FliS  28.93 
 
 
128 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  25.23 
 
 
145 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3037  flagellar protein FliS  29.59 
 
 
142 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  29.2 
 
 
144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  29.2 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>