87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0561 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  34.38 
 
 
258 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  34.38 
 
 
258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  34.38 
 
 
258 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  34.38 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  34.38 
 
 
258 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  34.77 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  33.98 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  32.81 
 
 
258 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  31.91 
 
 
254 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  31.49 
 
 
254 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  34.39 
 
 
266 aa  131  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  34.02 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  31.64 
 
 
261 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  30.62 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  30.96 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  30.2 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  31.42 
 
 
247 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  31.82 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  27.56 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  29.87 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  30.23 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  22.45 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  29.63 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  25.32 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  31.31 
 
 
264 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  29.67 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  23.13 
 
 
278 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  29.45 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  27.66 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  26.92 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  25.19 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  25.9 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  24.64 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  24.76 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  27.7 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  25.36 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  24.76 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  25 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  29.41 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  32.56 
 
 
264 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  25.36 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  24.76 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  30.69 
 
 
399 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  24.64 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  24.64 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  24.64 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 
259 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  24.64 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  30.85 
 
 
260 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  28.42 
 
 
296 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  26.92 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  32.65 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  29.03 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  28.66 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  32.61 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  31.52 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  31.31 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  31.52 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  26.47 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  31.31 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  28.87 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  31.91 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  32.94 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  31.91 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  32.94 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  33.33 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  35.59 
 
 
157 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  26.87 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  30.3 
 
 
261 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  23.4 
 
 
220 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.93 
 
 
402 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>