92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1118 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  94.57 
 
 		 258 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  94.57 
 
 		 258 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  93.41 
 
 		 258 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  80.48 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  75.39 
 
 		 287 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  76.56 
 
 		 269 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  78.88 
 
 		 261 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  77.2 
 
 		 261 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  74.61 
 
 		 268 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  74.22 
 
 		 277 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  72.4 
 
 		 245 aa  322  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  64.32 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  56.36 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  53.41 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  59.03 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  60.98 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  55.95 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  55.95 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  55.26 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  55.51 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  52.99 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  61.22 
 
 		 195 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  53.88 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  55.95 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  57.02 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  52.77 
 
 		 292 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  55.95 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  55.95 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  52.32 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  53.54 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  54.08 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  54.46 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  53.6 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  50.86 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  49.57 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  49.18 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  49.21 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  50 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  51.34 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  51.34 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  48.02 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  47.81 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  50.44 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  50.91 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  54.04 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  47.46 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  53.37 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  46.61 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  51.67 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  50.21 
 
 		 248 aa  191  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  52.27 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  51.52 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  53.11 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  52.05 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  48.21 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  46.78 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  43.98 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  46.59 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  38.33 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  45.03 
 
 		 218 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  45.55 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  37.08 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  41.18 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  38.24 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  41.01 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  36.94 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  32.88 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  35.59 
 
 		 296 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  35.03 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  31.22 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  28.87 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  33.14 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  23.44 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  30.88 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  23.36 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  28.57 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  25.83 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  25.17 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  28.03 
 
 		 254 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>