92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4037 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  99.23 
 
 
261 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  99.23 
 
 
261 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  93.09 
 
 
259 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  91.87 
 
 
248 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  92.28 
 
 
248 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  91.87 
 
 
248 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  84.38 
 
 
275 aa  440  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  85.71 
 
 
248 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  82.26 
 
 
258 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  79.69 
 
 
259 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  82.26 
 
 
262 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  80.24 
 
 
253 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  98.46 
 
 
195 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  77.24 
 
 
248 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  68.83 
 
 
259 aa  325  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  67.61 
 
 
259 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  65.38 
 
 
292 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  68.22 
 
 
256 aa  308  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  68.22 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  67.33 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  65.79 
 
 
248 aa  301  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  65.09 
 
 
252 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  65.09 
 
 
252 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  65.09 
 
 
252 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  64.66 
 
 
252 aa  296  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  65.09 
 
 
252 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  64.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  63.64 
 
 
254 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  68.35 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  61.57 
 
 
253 aa  278  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  64.1 
 
 
248 aa  277  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  64.07 
 
 
250 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  63.68 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  58.12 
 
 
254 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  66.23 
 
 
248 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  55.08 
 
 
282 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  49.61 
 
 
258 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  53.74 
 
 
287 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  55.56 
 
 
258 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  56 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  55.51 
 
 
258 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  55.56 
 
 
258 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  52.74 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  52.44 
 
 
269 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  52.68 
 
 
281 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  50.89 
 
 
245 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  54.19 
 
 
261 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  51.05 
 
 
268 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  59.6 
 
 
261 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  57.73 
 
 
255 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  51.14 
 
 
254 aa  191  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  47.9 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  50.23 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  50.68 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  50.41 
 
 
256 aa  188  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  54.04 
 
 
264 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  51.81 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  46.57 
 
 
276 aa  175  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  46.19 
 
 
205 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  47.16 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  44.39 
 
 
220 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  43.02 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  44.33 
 
 
218 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  46.88 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  37.78 
 
 
243 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  46.07 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  37.33 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  41.62 
 
 
264 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  37.05 
 
 
250 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  37.68 
 
 
362 aa  105  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  40 
 
 
267 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  34.63 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  33.17 
 
 
296 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  25.45 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  34.52 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  28.27 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  26.92 
 
 
258 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  29.33 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  26.45 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  38.38 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  30.3 
 
 
252 aa  42  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  26 
 
 
258 aa  42  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>