82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0978 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  47.48 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  43.36 
 
 		 265 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  43.51 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  39.61 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  36.58 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  35.8 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  35.8 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  35.8 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  36.19 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  35.41 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  35.41 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  35.02 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.02 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  34.63 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.27 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  36.8 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  31.92 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  32.28 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  31.89 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  40.61 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  31.23 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  31.25 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  33.85 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  38.07 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  33.16 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  33.92 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  36.12 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  28.65 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  27.95 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  31.33 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  30.95 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  29.56 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  28.3 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  24.24 
 
 		 292 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  30.38 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  25.27 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  27.55 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  29.59 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  24.48 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  30.91 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  27.19 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  25.15 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  28.46 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  26.99 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  24.73 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  28.83 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  27.59 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  24.73 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  30.15 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  31.34 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  28.22 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  28.1 
 
 		 420 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  21.77 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  26.88 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  29.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  27.42 
 
 		 281 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  27.74 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  25.62 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  30.93 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  26.14 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  24.73 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  26.58 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  28 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  28.38 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  26.96 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  30.69 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  26.96 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  30.93 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  29.85 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  24.32 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  31.34 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  26.09 
 
 		 258 aa  42  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  29.45 
 
 		 272 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>