100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0555 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  55.08 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  53.46 
 
 
261 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  52.03 
 
 
247 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  41.96 
 
 
258 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  40.29 
 
 
279 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  36.05 
 
 
254 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  36.05 
 
 
254 aa  178  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.02 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.8 
 
 
258 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  35.02 
 
 
258 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  36.51 
 
 
258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  34.85 
 
 
258 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  41.02 
 
 
266 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  33.85 
 
 
258 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  35.27 
 
 
258 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  34.44 
 
 
258 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  29.73 
 
 
260 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  32 
 
 
277 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  29.66 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  38.79 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  32.23 
 
 
252 aa  119  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  39.11 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  43.55 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  42.6 
 
 
246 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  36.36 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  26.28 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  27.66 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  34.91 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  36.48 
 
 
248 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  33.11 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  26.61 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  25.38 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  33.77 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  33.15 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  34.57 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  33.58 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  33.12 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  29.05 
 
 
272 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  32.85 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  32.48 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  32.85 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  33.12 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  32.54 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  31.48 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  31.95 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  24.26 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  33.12 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  32.32 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  32.3 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  33.12 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  31.75 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  31.4 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  31.25 
 
 
253 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  33.12 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  33.12 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  35.54 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  33.88 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  35.25 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  32.43 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  34.57 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  32.5 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  35.54 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  35.54 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  34.29 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  36.07 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  33.14 
 
 
259 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  29.92 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  37.1 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  37.1 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  37.1 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  37.1 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  32.32 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  32.53 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  33.93 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  31.54 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  32.52 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  32.23 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  30.86 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  33.54 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  54.76 
 
 
259 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  30.38 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  33.77 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1135  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  42.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  25.48 
 
 
243 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>