46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1883 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  48.74 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  55.08 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  44.92 
 
 
261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  43.36 
 
 
258 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.27 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  38.83 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  35.8 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  35.02 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  35.02 
 
 
258 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  34.63 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  34.63 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  34.63 
 
 
258 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  34.24 
 
 
258 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  35.02 
 
 
258 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  35.02 
 
 
258 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  33.85 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  31.54 
 
 
254 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  31.15 
 
 
254 aa  142  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  39.69 
 
 
266 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  31.78 
 
 
260 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  30.2 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  34.02 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  31.27 
 
 
256 aa  115  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  31.94 
 
 
264 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  30.97 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  36.44 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  32.93 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  25.87 
 
 
292 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  26.03 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  24.84 
 
 
276 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  29.88 
 
 
277 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  24.66 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  29.59 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  30.63 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  30.09 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  26.59 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  28.3 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  26.88 
 
 
254 aa  42.7  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  30.09 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  26.59 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  26.03 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  26.03 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  30.67 
 
 
262 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>