105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1982 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  83.45 
 
 
296 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  54.92 
 
 
292 aa  301  9e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  34.68 
 
 
214 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  35.1 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  36.02 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  31.73 
 
 
278 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  33.66 
 
 
195 aa  92.8  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  34.47 
 
 
252 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  34.47 
 
 
252 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  34.47 
 
 
252 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  34.47 
 
 
252 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  33.62 
 
 
267 aa  92.4  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  33.66 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  33.66 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  34.47 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  33.98 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  33.98 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  33.17 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  36.46 
 
 
276 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  33.17 
 
 
258 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  32.83 
 
 
255 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  31.88 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  34.78 
 
 
259 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  33.01 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  31.22 
 
 
258 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  34.72 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  33.15 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  31.55 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  32.6 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  34.9 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  29.76 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  32.95 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  30.73 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  32.34 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  32.77 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  30.73 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  29.76 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  33.89 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  32.77 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  33.89 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  31.07 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  33.01 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  31.25 
 
 
261 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  32.2 
 
 
258 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  31.49 
 
 
248 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  31.4 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  31.32 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  31.28 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  31.43 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  31 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  31.88 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  32.39 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  30.43 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  27.88 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  31.88 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  31.49 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  30.17 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  30.11 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  28.41 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  30.7 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  27.84 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  32.6 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  26.11 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  29.21 
 
 
218 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  31.19 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  28.4 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  27.09 
 
 
205 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  29.45 
 
 
252 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  29.73 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  28.15 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  28.79 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  26.03 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  27.48 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  27.59 
 
 
258 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  27.07 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  25.93 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  23.81 
 
 
254 aa  46.2  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  29.2 
 
 
256 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  25.81 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  26.67 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>