91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  93.46 
 
 
261 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  78.8 
 
 
258 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  78.8 
 
 
258 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  77.78 
 
 
268 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  75.49 
 
 
281 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  77.2 
 
 
258 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  75.3 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  74.1 
 
 
287 aa  352  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  75.78 
 
 
277 aa  348  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  77.2 
 
 
258 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  71.04 
 
 
245 aa  319  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  63.38 
 
 
278 aa  255  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  55.37 
 
 
272 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  53.91 
 
 
255 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  56.72 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  57.38 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  52.48 
 
 
292 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  52.26 
 
 
262 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  54.63 
 
 
261 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  54.63 
 
 
261 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  52.23 
 
 
248 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  53.82 
 
 
258 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  54.19 
 
 
261 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  52.26 
 
 
253 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  60 
 
 
195 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  53.64 
 
 
253 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 
259 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  49.6 
 
 
259 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  50.82 
 
 
275 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  55.07 
 
 
248 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  55.07 
 
 
248 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  55.07 
 
 
248 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  51.95 
 
 
264 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  54.19 
 
 
259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  47.64 
 
 
269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  51.07 
 
 
248 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  55.05 
 
 
254 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  52.17 
 
 
256 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  52.17 
 
 
256 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  51.67 
 
 
260 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  45.06 
 
 
258 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  51.15 
 
 
254 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  48.95 
 
 
254 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  49.36 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  47.3 
 
 
254 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  48.93 
 
 
252 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  48.93 
 
 
252 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  48.93 
 
 
252 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  50 
 
 
282 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  48.93 
 
 
252 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  48.5 
 
 
250 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  46.47 
 
 
254 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  51.5 
 
 
250 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  51.93 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  51.97 
 
 
248 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  44.02 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  51.27 
 
 
248 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  46.78 
 
 
253 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  47 
 
 
205 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  46.6 
 
 
220 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  46.07 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  44.16 
 
 
276 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  44.94 
 
 
214 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  35.68 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  47.12 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  40 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  34.85 
 
 
243 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  38.2 
 
 
267 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  38.1 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  34.23 
 
 
362 aa  99.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  35.63 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  35.03 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  34.66 
 
 
296 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  30.22 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  34.62 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  30.12 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  27.16 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  26.58 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  28.48 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  20.92 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  28.48 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>