103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3564 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  80.59 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  77.64 
 
 		 261 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  77.24 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  77.24 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  79.59 
 
 		 259 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  74.9 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  77.22 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  78.14 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  76.11 
 
 		 258 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  78.14 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  76.35 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  78.14 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  73.49 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  66.54 
 
 		 259 aa  332  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  83.51 
 
 		 195 aa  328  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  67.07 
 
 		 259 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  67.62 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  68.8 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  68.8 
 
 		 256 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  66.23 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  69.55 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  65.38 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  63.45 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  63.45 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  63.45 
 
 		 252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  301  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  61.98 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  301  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  63.45 
 
 		 252 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  63.03 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  68.95 
 
 		 272 aa  285  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  63.95 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  59.68 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  64.29 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  62.66 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  57.98 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  64.5 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  53.12 
 
 		 282 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  55.86 
 
 		 287 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  55.8 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  49.79 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  55.36 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  55.36 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  50.19 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  52.23 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  52.23 
 
 		 245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  54.46 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  53.6 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  54.05 
 
 		 281 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  53.74 
 
 		 261 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  52.79 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  55.56 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  54.23 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  56.99 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  49.77 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  50.91 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  50.45 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  48.77 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  49.14 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  50.76 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  45.92 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  44.62 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  47.15 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  37.75 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  38.94 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  38.67 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  47.92 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  42.7 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  40 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  39.09 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  37.32 
 
 		 362 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  38.84 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  34.3 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  31.4 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  25.79 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  35.37 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  28.65 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  31.58 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  30.92 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  33.1 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  30.34 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  29.21 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  29.78 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  29.21 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  29.21 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  29.21 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  28.65 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  28.49 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  25.86 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  25.86 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  29.59 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>