88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4844 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  100 
 
 
250 aa  501  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  99.2 
 
 
250 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  99.6 
 
 
250 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  94.8 
 
 
252 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  94.8 
 
 
252 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  94.8 
 
 
252 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  94.4 
 
 
252 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  94 
 
 
252 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  94.35 
 
 
254 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  81.63 
 
 
248 aa  401  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  78.23 
 
 
256 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  80.41 
 
 
248 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  77.82 
 
 
256 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  79.59 
 
 
248 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  77.55 
 
 
250 aa  359  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  77.59 
 
 
248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  67.39 
 
 
259 aa  310  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  63.24 
 
 
259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  62.85 
 
 
259 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  63.03 
 
 
248 aa  300  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  63.64 
 
 
260 aa  298  8e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  63.64 
 
 
258 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  61.75 
 
 
254 aa  296  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  65.35 
 
 
253 aa  295  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  64.78 
 
 
261 aa  294  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  64.78 
 
 
261 aa  294  9e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  64.76 
 
 
248 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  64.78 
 
 
261 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  61.35 
 
 
292 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  64.47 
 
 
262 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  63.2 
 
 
275 aa  285  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  65.2 
 
 
248 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  65.2 
 
 
248 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  65.2 
 
 
248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  65.64 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  68.78 
 
 
195 aa  261  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  56.07 
 
 
253 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  63.16 
 
 
272 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  55.13 
 
 
282 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  52.63 
 
 
287 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  53.74 
 
 
269 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  47.26 
 
 
258 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  48.48 
 
 
269 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  52.66 
 
 
245 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  50.91 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  50.21 
 
 
277 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  54.08 
 
 
255 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  49.07 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  47.32 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  47.32 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  48.48 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  49.31 
 
 
281 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  48.05 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  48.5 
 
 
261 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  50.44 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  48.13 
 
 
278 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  48.51 
 
 
256 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  47.24 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  50 
 
 
264 aa  161  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  47.18 
 
 
205 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  39.91 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  40.21 
 
 
220 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  38.98 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  40.18 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  38.98 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  41.11 
 
 
214 aa  119  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  41.59 
 
 
264 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  43.08 
 
 
218 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  42.13 
 
 
250 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  41.05 
 
 
204 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  37.55 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  34.95 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  33.98 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  30.22 
 
 
362 aa  89.4  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  33.65 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  25.36 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  31.58 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  31.93 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  28.83 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  30.83 
 
 
277 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>