46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0397 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  98.03 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  52.53 
 
 
260 aa  270  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  46.46 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  45.02 
 
 
256 aa  219  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  38.46 
 
 
261 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  35.17 
 
 
258 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  35.17 
 
 
258 aa  155  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  35.17 
 
 
258 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  35.17 
 
 
258 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  34.75 
 
 
258 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  34.38 
 
 
258 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  36.05 
 
 
267 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  34.3 
 
 
247 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  34.45 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  34.32 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  32.28 
 
 
258 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  34.75 
 
 
266 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  31.54 
 
 
265 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  31.49 
 
 
252 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  33.01 
 
 
279 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  27.23 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  25.48 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  28 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  29.22 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  24.83 
 
 
296 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  25.25 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  25.19 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  25.86 
 
 
248 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  26.02 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  23.81 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  26.28 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  24.75 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  26.88 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  28.93 
 
 
277 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  28.48 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  32.65 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0814  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.91 
 
 
444 aa  42.7  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0848  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.9 
 
 
442 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000210259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  26.26 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  25.7 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  29.14 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>