103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1990 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  567  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0164  hypothetical protein  47.09 
 
 		 258 aa  198  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3647  hypothetical protein  47.57 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3564  hypothetical protein  48.77 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1513  hypothetical protein  52.13 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3828  hypothetical protein  47.06 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.23857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3921  hypothetical protein  47.06 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4209  hypothetical protein  52.13 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1199  hypothetical protein  43.75 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4658  hypothetical protein  48.22 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2836  hypothetical protein  44.19 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1118  hypothetical protein  51.67 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4104  hypothetical protein  51.66 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4375  hypothetical protein  49.02 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0144  hypothetical protein  46.41 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4037  hypothetical protein  46.57 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4241  hypothetical protein  49.02 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4202  protein of unknown function DUF548  49.02 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2229  hypothetical protein  49.51 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552505  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3610  hypothetical protein  46.57 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  47.85 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4047  hypothetical protein  46.89 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2612  hypothetical protein  40.75 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.368816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3857  hypothetical protein  45.93 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0138  hypothetical protein  46.08 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16770  hypothetical protein  44.02 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4700  putative methyltransferase  47.98 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1459  hypothetical protein  43.13 
 
 		 261 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0100  hypothetical protein  47.06 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0305  SAM-dependent methyltransferase  47.47 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3825  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03346  predicted SAM-dependent methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0218  protein of unknown function DUF548  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0432  hypothetical protein  45.67 
 
 		 245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.759141  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3697  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3979  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0219  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3786  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3863  putative methyltransferase  47 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3796  putative methyltransferase  47 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3967  putative methyltransferase  47 
 
 		 252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4844  putative methyltransferase  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03299  hypothetical protein  47.24 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1077  hypothetical protein  43.3 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2080  hypothetical protein  42.69 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0819658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3906  putative methyltransferase  47 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3786  putative methyltransferase  47.76 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.711834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00529  SAM-dependent methyltransferase  42.73 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3910  putative methyltransferase  46 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  42.29 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1325  hypothetical protein  49.02 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001949  SAM-dependent methyltransferase  42.73 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39240  hypothetical protein  43.61 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1515  hypothetical protein  49.51 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3353  hypothetical protein  49.51 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1259  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.872111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1058  hypothetical protein  45.89 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.019854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0117  putative methyltransferase  47.47 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4038  putative methyltransferase  47.47 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2945  hypothetical protein  45.97 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0354  hypothetical protein  47.34 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0006  putative methyltransferase  46.46 
 
 		 250 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  44.16 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4480  putative methyltransferase  45.96 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4197  putative methyltransferase  45.96 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0860  hypothetical protein  41.63 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.301804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0009  putative methyltransferase  46.97 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1802  hypothetical protein  38.52 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  43.16 
 
 		 243 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1882  hypothetical protein  41.81 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1046  hypothetical protein  41.62 
 
 		 205 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.183803  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1343  protein of unknown function DUF548  39.71 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3348  hypothetical protein  40.7 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.870462  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17290  Protein of unknown function (DUF548)  39.64 
 
 		 214 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.559869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2240  hypothetical protein  40.89 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2042  hypothetical protein  41.12 
 
 		 218 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0893  protein of unknown function DUF548  37.82 
 
 		 250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1704  hypothetical protein  36 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.498266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2074  hypothetical protein  40.2 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4001  protein of unknown function DUF548  42.35 
 
 		 204 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  36.06 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45482  predicted protein  34.06 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0494744  unclonable  0.00000000143432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  34.81 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  32.32 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  25.97 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  29.68 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  25.97 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  26.88 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  25.97 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  25.18 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  25.97 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  25.97 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  27.22 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  25.11 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  26.59 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  26.11 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  25.35 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>