33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1554 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1554  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.66635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1767  hypothetical protein  52.16 
 
 
277 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00162689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0413  hypothetical protein  52.92 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.252366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0397  hypothetical protein  52.53 
 
 
254 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1379  hypothetical protein  47.27 
 
 
256 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1923  protein of unknown function DUF548  33.97 
 
 
261 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1883  hypothetical protein  31.78 
 
 
265 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0978  hypothetical protein  31.23 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000585304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2234  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2317  hypothetical protein  28.81 
 
 
258 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000235333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2180  hypothetical protein  29.11 
 
 
258 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2009  putative protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  29.11 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2129  protein of unknown function DUF548  30.92 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0247639  normal  0.0288385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0561  hypothetical protein  30.62 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2020  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000191415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2197  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00498604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2174  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1991  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  28.15 
 
 
258 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0029023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0555  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1973  protein-L-isoD(D-D) O-methyltransferase  27.85 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00083669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1619  protein-L-IsoD(D-D) O-methyltransferase  29.65 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000080057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3136  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  normal  0.0238727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  28.05 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2731  protein of unknown function DUF548  27.8 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000173864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3493  hypothetical protein  23.39 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3429  hypothetical protein  23.55 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2441  hypothetical protein  21.62 
 
 
292 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  24.14 
 
 
527 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1801  hypothetical protein  25 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3348  hypothetical protein  23.78 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3415  hypothetical protein  23.32 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.108724 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0108  SAM-dependent methyltransferase  27.43 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1982  hypothetical protein  20.96 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.582001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>