77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2452 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  818    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  56.61 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  53.73 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  52.55 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  48.51 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  49.25 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  47.12 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  33.51 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  32.64 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  31.07 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  32.92 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  30.46 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  27.11 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  28.5 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  25.74 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.8 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  27.88 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  26.17 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  26.95 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  26.94 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  25.81 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  26.3 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  26.3 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  26.3 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  28.85 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  26.59 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  26.77 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  27.15 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  25.81 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  25.81 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  25.3 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  24.22 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  28.76 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  23.97 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  25.57 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  26.72 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  25.27 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  26.84 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  28.05 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  24.23 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  26.53 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  29.08 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  26.01 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  28.29 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  24.86 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  25.43 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  24.85 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  23.92 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  25.2 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  26.29 
 
 		 477 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  23.06 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  25.14 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  25.67 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  32.26 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00159  hypothetical protein  27.45 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  32.17 
 
 		 266 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 193 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  38.96 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1190  O-methyltransferase family 3  24.35 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  31.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  34.94 
 
 		 209 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  33.33 
 
 		 241 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  32.26 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0807  O-methyltransferase family protein  26.32 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0035936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1834  (Uracil-5)-methyltransferase  35 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  28.99 
 
 		 214 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  33.75 
 
 		 174 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  32.22 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1473  O-methyltransferase family 3  29.76 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0273584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.06 
 
 		 180 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  30.49 
 
 		 192 aa  43.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  32.14 
 
 		 244 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  21.7 
 
 		 474 aa  42.7  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>