27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2684 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  100 
 
 		 319 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0681  I protein  53.55 
 
 		 155 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0756  I protein  53.55 
 
 		 155 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  71.88 
 
 		 127 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  71.88 
 
 		 127 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  34.11 
 
 		 373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  28.66 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  38.6 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  38.6 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  31.17 
 
 		 370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  40.11 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  29.9 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  29.54 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  29.46 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  27.53 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  32.75 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  28.99 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  28.03 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  23.76 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  41.03 
 
 		 111 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  28.52 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  27.05 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  32.82 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  36.14 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  27.86 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  26.72 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  30.08 
 
 		 389 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>