23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1964 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1964  I protein  100 
 
 		 334 aa  673    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  33.56 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  29.97 
 
 		 373 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  32.64 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  30.03 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  38.64 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  36.88 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  30.34 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  28.27 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  29.07 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  30.77 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  27.37 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  49.38 
 
 		 111 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  29.24 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  28.02 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  28.02 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  26.74 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  40.66 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  44.62 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  26.42 
 
 		 368 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  31.36 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  31.88 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  36.84 
 
 		 191 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>