25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0094 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  98.3 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  41.13 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  35.69 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  30.06 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  28.77 
 
 		 394 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  42.54 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  29.38 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  39.78 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  34.16 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  30.82 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  36.84 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  36.84 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  36.67 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  35.14 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  38.64 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  27.98 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  26.36 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  25.8 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  40.74 
 
 		 111 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  27.15 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  35.04 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  40.23 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  40.23 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  26.79 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>