21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1558 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  100 
 
 		 191 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  67.97 
 
 		 320 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  35.5 
 
 		 373 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  32.75 
 
 		 319 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  33.33 
 
 		 328 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  37.5 
 
 		 323 aa  81.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  36.76 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  35.07 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  35.07 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  36.22 
 
 		 310 aa  77.8  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  30.65 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  33.87 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  28.23 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  42.47 
 
 		 359 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  34.02 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  34.02 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  39.44 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  31.34 
 
 		 394 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  29.23 
 
 		 373 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  36.36 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  36.84 
 
 		 334 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>