23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4499 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  100 
 
 		 370 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  41.48 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  41.48 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  36.59 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  45.4 
 
 		 328 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  31.17 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  29.44 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  43.8 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  36.92 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  30.05 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  35.29 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  36.76 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  25.59 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  39.13 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  39.13 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  27.42 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  48.1 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  32.73 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  26.78 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  26.03 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  34.88 
 
 		 111 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  22.32 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  31.3 
 
 		 386 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>