25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3003 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3003  I protein  100 
 
 		 323 aa  651    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  36 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  37.22 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  35.01 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  33.82 
 
 		 373 aa  132  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  32.39 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  30.46 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  29.72 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  32.76 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  28.8 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  34.13 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  34.13 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  32.56 
 
 		 235 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  30.52 
 
 		 368 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  37.29 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  30.59 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  29.51 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  37.5 
 
 		 191 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  39.37 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  29.68 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  50.6 
 
 		 111 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  34.27 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  32.26 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0756  I protein  25.81 
 
 		 155 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0681  I protein  25.81 
 
 		 155 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>