24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1638 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  699    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  41.16 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  40.11 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  32.68 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  34.57 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  34.46 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  34.72 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  33.83 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  32.85 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  32.59 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  28.57 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  46.94 
 
 		 111 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  30.8 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  27.09 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  36.92 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  27.88 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  34.09 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  28.18 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  28.18 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  26.91 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  28.68 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  34.88 
 
 		 127 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  34.88 
 
 		 127 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  31.25 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>