14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0757 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  100 
 
 		 127 aa  259  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  71.88 
 
 		 319 aa  156  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  54.02 
 
 		 373 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  39.13 
 
 		 370 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  38.24 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  38.3 
 
 		 368 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  37.14 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  37.14 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  40.23 
 
 		 310 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  32.58 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  34.02 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  36 
 
 		 373 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  34.88 
 
 		 350 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>