20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0673 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  100 
 
 		 320 aa  634    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  67.97 
 
 		 191 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  29.46 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  36.99 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  33.73 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  36.55 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  35.8 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  30 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  28.17 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  30.77 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  27.57 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  27.57 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  30.28 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  30.04 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  32.58 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  32.58 
 
 		 127 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  25.52 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  37.04 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  25.57 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  26.39 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>