20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3052 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  98.3 
 
 		 310 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  41.58 
 
 		 328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  34.67 
 
 		 323 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  29.63 
 
 		 319 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  28.11 
 
 		 394 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  28.46 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  40.65 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  37.07 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  36.44 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  36.44 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  28.94 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  43.66 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  33.52 
 
 		 320 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  26.72 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  41.27 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  36.96 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  44.62 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  26.56 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>