22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0734 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  781    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  41.16 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  34.97 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  36.07 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  36.01 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  33.24 
 
 		 375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  36.93 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  57.47 
 
 		 111 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  27.81 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  26.26 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  37.11 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  36.76 
 
 		 271 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  35.34 
 
 		 373 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  30.84 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  30.65 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  27.42 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  24.03 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  35.2 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  35.2 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  37.8 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  22.11 
 
 		 246 aa  49.7  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  31.34 
 
 		 191 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>