17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2096 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  100 
 
 		 375 aa  760    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  91.96 
 
 		 386 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  75.95 
 
 		 389 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  35.11 
 
 		 394 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  34.46 
 
 		 350 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  32.59 
 
 		 373 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  31.43 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  49.43 
 
 		 111 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  36.07 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  34.53 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  25.45 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  36.67 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  35.04 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  28.52 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  29.82 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1744  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  58.54 
 
 		 44 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328119  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  26.48 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>