21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3080 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  100 
 
 		 111 aa  233  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  57.47 
 
 		 394 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  46.94 
 
 		 350 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  49.43 
 
 		 373 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  50.57 
 
 		 389 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  50.57 
 
 		 386 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  49.43 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  50.6 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  45.98 
 
 		 359 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  40.7 
 
 		 373 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  41.05 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  40.74 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  42.5 
 
 		 328 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  41.03 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  46.07 
 
 		 334 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  41.27 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  35.44 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  34.88 
 
 		 370 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  36.36 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  37.14 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  33.85 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>