25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3358 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  100 
 
 		 368 aa  725    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  48.53 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  48.53 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  37.75 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  44.57 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  40.64 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  40.29 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  37.43 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  29.36 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  30.49 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  41.79 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  31.94 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  38.3 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  38.3 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  36.29 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  47.69 
 
 		 235 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  34.09 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  32.14 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  35.44 
 
 		 111 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  26.83 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  35.23 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  23.2 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  23.8 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  28.75 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  28.99 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>