20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0674 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  100 
 
 		 389 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  75.26 
 
 		 386 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  75.95 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  36.07 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  34.57 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  33.65 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  50.57 
 
 		 111 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  30.17 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  39.58 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  35.07 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  26.74 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  31 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  35.37 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1744  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  65.85 
 
 		 44 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328119  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  23.48 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  29.5 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  35.16 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  33.59 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  30.88 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  30.88 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>