23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2245 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  730    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  39.84 
 
 		 350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  35.13 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  31.8 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  31.69 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  33.05 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  33.53 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  30.28 
 
 		 359 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  29.29 
 
 		 334 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  49.43 
 
 		 111 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  29.87 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  26.08 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  26.02 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  28.03 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2098  Mu-like prophage I protein-like protein  28.73 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1302  Mu-like prophage I protein-like protein  28.73 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  33.57 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  24.43 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  32.43 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  28.57 
 
 		 191 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  26.57 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0680  I protein  36 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0757  I protein  36 
 
 		 127 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>