21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0244 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0244  Mu-like prophage I protein, putative  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.244202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1880  Mu-like prophage FluMu I protein  43.97 
 
 
359 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0734  hypothetical protein  36.76 
 
 
394 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1608  Mu-like prophage I protein  34.03 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2143  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  32.68 
 
 
386 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.32747  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1638  hypothetical protein  27.46 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2096  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  36.13 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.581443  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3003  I protein  34.27 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0094  hypothetical protein  25.41 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213264  normal  0.218715 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0674  prophage MuSo1, protein Gp32, putative  34.88 
 
 
389 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3080  Mu-like prophage I protein-like  41.05 
 
 
111 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583499  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0268  hypothetical protein  34.08 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2392  Mu-like prophage I protein-like  35.71 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1558  Mu-like prophage I protein-like  28.23 
 
 
191 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2245  hypothetical protein  24.43 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0673  putative prophage MuSo2 protein  25.52 
 
 
320 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.485399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2684  prophage MuSo2, protein Gp32, putative  26.72 
 
 
319 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1964  I protein  31.36 
 
 
334 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.270907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3052  Mu-like prophage I protein  22.8 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4499  Mu-like prophage I protein-like protein  22.32 
 
 
370 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal  0.147387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3358  Mu-like prophage I protein-like protein  30 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>