167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1466 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.09 
 
 
223 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.87 
 
 
205 aa  89  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  31.14 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.16 
 
 
226 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  28.04 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  32.09 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  29.56 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  35.14 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  35.93 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  31.35 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  36.56 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  28.64 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  35.48 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  35.5 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  36.46 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  30.95 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  30.73 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  34.88 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  27.42 
 
 
371 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  30.05 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  26.4 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.12 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  33.7 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  26.52 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  28.88 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  32.32 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  29.63 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  28.72 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  29.63 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.96 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  32.14 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.35 
 
 
197 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  29.26 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30 
 
 
220 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.8 
 
 
196 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  28.88 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  25 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  32.24 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  27.81 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  30.77 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  22.41 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  23.26 
 
 
197 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  33.53 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  28.65 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  27.89 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  31.28 
 
 
213 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  27.72 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  27.32 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  29.63 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.3 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  32.85 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  30.53 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  22.34 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  25.24 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  32.47 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  29.38 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  28.14 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  30 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  29.41 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  29.41 
 
 
210 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0787  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.56 
 
 
139 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  24.85 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  27.74 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  31.55 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  23.89 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  30 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  24.83 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0837  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.33 
 
 
349 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0756142  normal  0.0499853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  21.31 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  34.38 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0787  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  29.41 
 
 
347 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  26.84 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  27.81 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.81 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1210  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
135 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.79074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  27.67 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  24.73 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  23.91 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  26.87 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0088  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase  36.99 
 
 
352 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.13 
 
 
181 aa  48.5  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  25.53 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  26.34 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3186  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  34.67 
 
 
353 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213087  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1850  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  29.21 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.733521  normal  0.124901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1833  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  39.53 
 
 
333 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.54401  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0557  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  37.1 
 
 
275 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.1771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  25.74 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  25.74 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  23.12 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  32.04 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2354  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  41.38 
 
 
351 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5262  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.35 
 
 
459 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>