145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1876 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  48.68 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  49.43 
 
 		 197 aa  171  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  38.71 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  36.65 
 
 		 209 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  35.94 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  32.11 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  32.98 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  38.14 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  34.43 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  32.32 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  35.48 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  36.42 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  30.86 
 
 		 212 aa  95.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  37.85 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  35.22 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  35.98 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  30.46 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.32 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  31.55 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  27.93 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  34.03 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  33.15 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  30.18 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.93 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  28.99 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  31.05 
 
 		 371 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  29.94 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  29.05 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  28.4 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  32.98 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  39.62 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  25.44 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  31.5 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.84 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  28.99 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  33.67 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.01 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  33.92 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  29.07 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  32.37 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  31.21 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  26.56 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.08 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  28.42 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.32 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  24.08 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  31.25 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  21.29 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  27.81 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  28.8 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  29.32 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  30.17 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.47 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  29.9 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  32.58 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  25.89 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  29.31 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  29.26 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  30.83 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  27.54 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.23 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  31.72 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  25.93 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  22.7 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  28.66 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  31.07 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  26.95 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  30.22 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  22.44 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  22.44 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  27.5 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  25.86 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  24.26 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  23.53 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  24.49 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  25.82 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  29.79 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  27.08 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  24.1 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  22.75 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  33.02 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  29.7 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  29.63 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  30.56 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  23.78 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  25.26 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  30.56 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  32.32 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  30.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  30.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  30.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  30.56 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>