More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2647 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  100 
 
 
213 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  44.29 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  44.23 
 
 
209 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  43.96 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  42.29 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  43.48 
 
 
195 aa  145  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  40.49 
 
 
192 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  43.18 
 
 
209 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  43 
 
 
204 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  40.93 
 
 
220 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  38.29 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  35.92 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
220 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  35.75 
 
 
190 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  34.98 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  37.06 
 
 
197 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  36.89 
 
 
223 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  37.62 
 
 
210 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  40.1 
 
 
212 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  36.79 
 
 
204 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  34.6 
 
 
221 aa  121  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.33 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  36.67 
 
 
214 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.16 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
217 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.86 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  32.35 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  32.68 
 
 
206 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  35.32 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  36.63 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  34.64 
 
 
192 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  34.47 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  39.11 
 
 
202 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  36.32 
 
 
212 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  33.83 
 
 
203 aa  108  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  35.12 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  33.99 
 
 
211 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.71 
 
 
365 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.43 
 
 
217 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  39.86 
 
 
174 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  36.14 
 
 
202 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  38.46 
 
 
207 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  35.12 
 
 
371 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  29.56 
 
 
220 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  29.25 
 
 
226 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  32.12 
 
 
219 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  38.67 
 
 
194 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  32.11 
 
 
195 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  31.6 
 
 
216 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.99 
 
 
209 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  31.98 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  31.22 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
229 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  29.58 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.28 
 
 
197 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  30.29 
 
 
218 aa  94.7  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  29.74 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  30.58 
 
 
210 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  30.39 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  32.57 
 
 
226 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  27.57 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  35.05 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  33.87 
 
 
191 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  30.14 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  31.37 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  29.67 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  34.02 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  27.62 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  27.59 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  27.59 
 
 
214 aa  85.1  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  27.65 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  31.94 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  32 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  28.92 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  27.88 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  30.99 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  37.07 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  28.78 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  27.14 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  27.4 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  29.58 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  28.88 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  27.4 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  26.61 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.77 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  30.66 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  27.75 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.15 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  26.61 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  30.25 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  29.24 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  26.09 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  28.57 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  26.22 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  28.42 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  30.18 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  28.47 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  27.87 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>