More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2576 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  44.44 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  37.88 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  34.98 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  36.57 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  34.16 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  31.98 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  31.98 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  31.16 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  31.66 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  30.2 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  31.34 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  31.03 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  30.56 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  31.03 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  30.05 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  33.01 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  31.75 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  29.56 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  30.48 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  30.62 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  26.18 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  29.76 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  26.92 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  26.07 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  29.08 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  33.76 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  24.88 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  32.18 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  29.67 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  30.24 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  25 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.55 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  32.16 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  29.61 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.22 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.59 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  30.15 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.69 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  34.82 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  34.82 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  27.46 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  28.37 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2575  transferase, putative  27.04 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211269  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  27.78 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  30.96 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  24.02 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  30.73 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  27.18 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  28.85 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  29.79 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  29.59 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  32.54 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  32.04 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  27.23 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  34.48 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  28.08 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  28.08 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  26.19 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  23.24 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  30.43 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  27.59 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  35.25 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1362  hexapaptide repeat-containing transferase  36.29 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  27.23 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  26.7 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  29.01 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  35.29 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  31.25 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  33.79 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  26.92 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  34.11 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  28.23 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  32.06 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  27.21 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  24.88 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3214  transferase, putative  28.68 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  25.63 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  28.78 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  32.12 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  29.65 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  28.5 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2423  acetyltransferase  34.4 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  26.57 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  35.78 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  32.88 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  35 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  26.49 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  32.79 
 
 		 172 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  31.62 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  27.86 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.82 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  26.44 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  30.92 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  28.44 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  27.54 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>