297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3311 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  71.04 
 
 
221 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  58.18 
 
 
220 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  50.23 
 
 
226 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  54.29 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2311  hexapaptide repeat-containing transferase  50.91 
 
 
225 aa  224  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0450903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0320  Acyl-(acyl carrier protein)-like protein  47.44 
 
 
217 aa  214  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2575  transferase, putative  48.82 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211269  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  51.72 
 
 
223 aa  210  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3214  transferase, putative  49.07 
 
 
219 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3749  hexapaptide repeat-containing transferase  47.37 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2356  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  44.65 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  43.2 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  43.24 
 
 
224 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0707  hypothetical protein  37.84 
 
 
222 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.727411  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  26.07 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3842  hypothetical protein  34.58 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0203938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  28.99 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  28.89 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  27.56 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  24.1 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  26.7 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  26.7 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  29.14 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  24.52 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  24.76 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  26.24 
 
 
371 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  28.57 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  28.57 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  25 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.3 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  28.24 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  26.24 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  28.12 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  29.82 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  23.96 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0288  hypothetical protein  37.89 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.038909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  33.56 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  25.88 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  29.23 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  31.62 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  26.02 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06181  hypothetical protein  27.4 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00985  hypothetical protein  27.4 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  26.47 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  26.03 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  30.94 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  27.04 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  29.92 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  29.5 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  29.29 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  25.15 
 
 
206 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.49 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  29.79 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  29.73 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0607  hypothetical protein  30.3 
 
 
194 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172957  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  25.34 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.56 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  30.61 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  28.81 
 
 
195 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  25.3 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  26.85 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3019  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  35.37 
 
 
346 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00996453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  25 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  26.32 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  25 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  24.57 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  23.41 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  27.67 
 
 
196 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  28.12 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  28.57 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  32.99 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  32.99 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.78 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.57 
 
 
193 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  25.16 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  26.45 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  25.38 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  27.41 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  25.13 
 
 
205 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  24.88 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  25.87 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.76 
 
 
550 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  25.87 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  21.23 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1219  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.67 
 
 
357 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.873415  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  26.53 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  26.98 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2647  hypothetical protein  26.85 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4428  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  27.41 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.0483089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  29.19 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  24.63 
 
 
192 aa  52  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  26.32 
 
 
191 aa  52  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  30.41 
 
 
251 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  25.37 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  24.63 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  30.83 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  26.32 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0615  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  25.16 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.135352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>