254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2356 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2356  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  52.15 
 
 
219 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  45.95 
 
 
226 aa  215  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2575  transferase, putative  48.39 
 
 
217 aa  205  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211269  normal  0.535358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2776  acyl-(acyl carrier protein)-like protein  45.75 
 
 
218 aa  198  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3311  hexapaptide repeat-containing transferase  44.65 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0201996  normal  0.383488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0828  acyltransferase  44.75 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.382027  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  44.19 
 
 
221 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2311  hexapaptide repeat-containing transferase  43.78 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0450903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0320  Acyl-(acyl carrier protein)-like protein  43.81 
 
 
217 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0383339  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3749  hexapaptide repeat-containing transferase  42.27 
 
 
218 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3214  transferase, putative  38.36 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  37.85 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0707  hypothetical protein  31.36 
 
 
222 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.727411  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3427  hypothetical protein  28.89 
 
 
224 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0468682  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  23.19 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.39 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  25.71 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  26.82 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  27.98 
 
 
212 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  23.65 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  26.83 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  25.99 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  23.83 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  24.49 
 
 
365 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  27.41 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  29.17 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  22.17 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  24.5 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  26.21 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  30.82 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1564  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  31.2 
 
 
340 aa  58.5  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128344  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  24.83 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  26.37 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  26.11 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1764  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylateN- ac etyltransferase  30.95 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  25.9 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  26.63 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  21.14 
 
 
191 aa  55.5  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  26.58 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  22.07 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  25.34 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2647  hypothetical protein  29.33 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  22.99 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  24.44 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  28.47 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  24.58 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  26.01 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  23.08 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.91 
 
 
193 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  26.42 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2875  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.98 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  25.85 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  22.5 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  20.74 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4281  hypothetical protein  24.39 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0607  hypothetical protein  26.87 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172957  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  22.78 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  34.48 
 
 
174 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  26.21 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  24.22 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  30.51 
 
 
174 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  21.84 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3842  hypothetical protein  26.61 
 
 
111 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0203938 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  25.55 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1527  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.14 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.584038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  24.82 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  24.35 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  25.55 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  30.17 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1340  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase, LpxD  32.74 
 
 
352 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0613  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.73 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1639  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  24.26 
 
 
196 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00985  hypothetical protein  29.1 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06181  hypothetical protein  29.1 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  23.2 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  21.95 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  25.29 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  21.84 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2805  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000424763  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1280  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  27 
 
 
340 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000197403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.31 
 
 
233 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14121  hypothetical protein  29.84 
 
 
172 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  33.72 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00419  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.95 
 
 
453 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1491  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000340035  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1455  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000680576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2892  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979976  normal  0.694988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0294  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase LpxD  29.51 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  28.95 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1149  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.98 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000218534  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3408  carbonic anhydrase  30.77 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50052  normal  0.517344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1460  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  33.01 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000103584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  23.74 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2080  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  27.46 
 
 
351 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307113  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3151  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  30.1 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000238137  normal  0.02646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2970  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  25.63 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  25.86 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>